Вторая часть ставшей очень популярной оригинальной игры вышла в апреле 1988-го года. Когда мы последний раз видели Пола и Винса - героев Ikari Warriors 2, они спасли полковника и направились домой на специальном самолете, предоставленного им генералом. Внезапно небо почернело, океан стал неспокойным, и самолет стремительно начал терять высоту. Попав во временную яму, герои попадают в далекое будущее, где вынуждены сражаться с очередной армией захватчиков.

Технические характеристики игры практически не улучшились по сравнению с первой серией, не смотря на то, что прошел целый год. Есть также определенные неудобства в управлении персонажами.