Создано и опубликовано Konami и Ultra в апреле 1990-го года. Действия разворачиваются в 1998-м - спустя три года после инцидента с Внешними Небесами в Южной Африке. Главный герой по имени Снейк (Snake) вновь призван в ряды группы Фоксхаунд. Бывший монгольский пастух по имени Higharolla Kockamamie совсем спятил и стал заниматься изготовлением оружия массового поражения. Снейк, который с прошлой миссии заметно поднакачался, жаждет пламенной встречи с негодяем.

Главный герой в компании с двумя экспертами - Ником Майером и Джоном Тернером тайно проникают на территорию крепости, где полным ходом идет производство опасного оружия. Итак, военная операция началась...